Структура федеральных органов исполнительной власти утверждена Указом Президента № 649 от 20 мая 2004 г. Положение о Федеральной службе в сфере здравоохранения и социального развития утверждено Постановлением Правительства № 323 от 30 июня 2004 г. 22 ноября 2004 г. Приказом Министерства здравоохранения  Российской Федерации № 844н от 13.08.2020 было утверждено «Положение о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения  по субъекту Российской Федерации». (Положение о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения  по Ростовской области, утвержденное приказом Росздравнадзора от 06.10.2020 №9187)

В настоящее время штатная численность Территориального органа Росздравнадзора по Ростовской области составляет двадцать четыре единицы